Un synopsis est également disponible sur le site dédié à Ground Zeroes. Voici donc ce que l'on peut en retenir :

L'histoire prend place en 1975, à la fin du conflit Vietnamien. Snake et son groupe de mercenaires MSF (Militaires sans frontières) font face à des rumeurs disant que le groupe aurait en sa possession l'arme nucléaire, causant la panique aux quatre coins du globe. Alors que l'inspection de la Motherbase est imminente, Snake apprend que l'espionne "Paz" (découverte dans Peace Walker) qui a déjà infiltré la Motherbase est en vie et est interrogée dans une base navale américaine, dans le sud de Cuba.

Chico tente d'aller secourir Paz, mais ce dernier se fait capturer ; il arrive tout de même à envoyer un message de détresse à Snake.  Ce dernier n'a que peu d'options, il décide d'embarquer pour une nouvelle mission : sauvez Paz et Chico, pendant que la Motherbase se prépare à recevoir la visite de l'inspection nucléaire.

Même si il n'y a rien de bien nouveau, cela pose donc l'histoire que l'on retrouvera au printemps prochain sur Xbox 360, PS3, Xbox One et PS4.